ولد هشام مطر في عام 1970 في مدينة نيويورك حيث كان والده، جبالة مطر، يعمل لصالح الوفد الليبي في الأمم المتحدة. عندما كان عمره ثلاث سنوات، عادت عائلته إلى طرابلس، ليبيا حيث قضى طفولته الأولى حتى اضطرت الاضطهاد السياسي والدته للفرار مع الأطفال أولاً إلى كينيا ثم إلى مصر، حيث استقروا في القاهرة والتحق هشام وشقيقه زياد بمدرسة تضم 70 تلميذًا في كل فصل دراسي (المدرسة الوحيدة التي يمكنهم تحمل تكاليفها). في وقت لاحق، تمكن والد هشام من الخروج من ليبيا والانضمام إليهم.
في القاهرة، بدأ والد هشام عمله السياسي بجدية: كتابة مقالات ضد نظام ليبيا وتعبئة الفصائل المختلفة من المقاومة الليبية المنفية للتوحد من أجل الإطاحة بالنظام. في عام 1986، انتقل هشام إلى لندن، إنجلترا حيث حصل على درجة في الهندسة المعمارية. في عام 1990، بينما كان هشام
